净化无尘车间的施工，是指除土建施工以外的其他工种的施工。它包含的专业多、工种多，所以施工组织设计及现场协调统筹工作至关重要。若没有好的项目经理及综合素质高的技术管理人员，就很难保质保量地完成任务。
净化无尘车间装修施工的种类繁多，每个无尘车间的施工都有其自身的特点。用途不同，材料不同，施工工序也不同。下面以固体制剂制药车间为例，介绍其施工程序，其他的净化无尘车间施工流程可以此作为参考资料，进行适当修改即成。
新建的无尘车间，大都是以土建框架结构为外壳，在其内采用满足要求的轻型壁板材料(如彩钢夹芯复合板)进行分割、装修，即通常所说的大房子里套小房子的模式。在土建外壳完工，外门、外窗安装完毕并把现场清理干净后，方可进行净化空调工程的施工。
总的施工程序：先有尘作业，后无尘作业，不允许二者交叉作业，否则会影响工程质量。也就是说，把所有产尘作业完成后，才可以进行不产尘的作业。产尘的作业有：各种管道的支架、吊架的安装，各种吊杆、吊件的安装，管道的焊接，等等。这就需要各专业、各工种在施工组织设计中，把这些在安装过程中产尘的作业排列在前，由项目经理及相关技术人员进行统筹安排。即使该工种还不到进场的时间，也应派少量人员先进场进行相关的产尘作业。也可由各专业产尘作业的有关操作人员组成施工组，先进场进行各自的吊杆、吊件等产尘作业的安装。待产尘作业基本完工后，再按总的施工组织设计确定的施工工序，安排相关专业依次进场施工，这是比较理想的施工顺序。在实际施工中，经常是分专业、分工种、分时段进场。这种安排便于各专业、各工种的管理，但很容易出现有尘与无尘的交叉作业情况，这种施工安排应尽量避免。若不可避免，应做好防尘保护及有效清洁工作。
对一般固体制剂的净化无尘车间的施工，应按以下程序进行。
1、管道支架、吊架安装
(1)净化空调专业的管道组(风管及水管组)，根据施工图安装风管支架，吊架，水管支架，吊架(自来水管、空调冷水管、去离子水管等)，若施工图纸深度不够的话，应由施工单位进行二次设计;由设备组安装高效送风口等设备的吊杆、吊件。
(2)洁净室装修组按现场二次设计图纸，安装顶棚吊件、吊杆。多数洁净室装修图纸深度不够，均需在现场二次设计来确定相关尺寸。
(3)由消防施工组安装消防管道支架、吊架。
(4)由电气、自控安装组安装电缆桥架吊杆。
以上各专业、各工种在安装吊架、吊杆过程中，应由各专业技术人员相互协调，由项目经理统筹，按施工图设计的标高进行安装。若遇到管道交叉、标高冲突时，应会同设计人员合理避让。总的原则：小管道避让大管道，不可各自为政。